首先，免疫耐受的誘導(dǎo)、維持和破壞影響著許多臨床疾病的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸。人們企圖誘導(dǎo)和維持免疫耐受性來防治超敏性疾病、自身免疫性疾病以及移植物的排斥反應(yīng)。某些感染性疾病以及腫瘤生長過程中，設(shè)法解除免疫耐受、激發(fā)免疫應(yīng)答將有利于對病原體的清除及腫瘤的控制。

　　根據(jù)免疫耐受發(fā)生機制的多樣性，對Ⅰ型變態(tài)反應(yīng)患者誘導(dǎo)免疫耐受的可能途徑是通過B克隆清除或主動抑制。處理的方法有注射表面高密度多聚耐受原、變性蛋白抗原或脫敏療法等。

　　自身免疫病的發(fā)生至今認為主要與自身耐受的破壞有關(guān)，去除導(dǎo)致耐受破壞的因素，當(dāng)然有利于對自身免疫病的防治。

　　現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雖然已將古人幻想的器官移植變?yōu)楝F(xiàn)實，但同種異體免疫排斥現(xiàn)象仍是器官移植中主要存在的問題。免疫抑制療法上的進步有利于延長移植物存活，但非特異抑制所帶來的副作用仍有待解決。若能將特異抑制(免疫耐受)成功地應(yīng)用于臨應(yīng)，收到較好的效果，無疑是在此領(lǐng)域中的重大突破。

　　在麻風(fēng)及慢性粘膜皮膚念珠菌病患者中，若體內(nèi)出現(xiàn)良好的細胞免疫應(yīng)答，雖抗體生成低下或甚至缺如，臨床預(yù)后仍良好，并常伴隨有效的防御性免疫。反之，如細胞免疫水平低下，抗體效價雖高，而預(yù)后較差，多呈進行性感染。這種分離耐受現(xiàn)象對感染性疾病的預(yù)后有重要影響。乙型肝炎病毒攜帶者伴有極輕微的肝炎病變，可能與新生期發(fā)生感染而使機體對病毒產(chǎn)生部分耐受性有關(guān)。

　　在對腫瘤患者的免疫治療中，解除患者的免疫耐受狀態(tài)也是一項有意義的措施。近年，美國兩家實驗室報導(dǎo)將一種協(xié)同刺激因子B7的基因轉(zhuǎn)染黑色素瘤細胞，并用這種轉(zhuǎn)染細胞進行防治黑色素瘤的實驗性研究，獲得可喜的成功。為這一領(lǐng)域的研究開闊了新的途徑。