最新出版的《中國高等教育評估》雜志刊登了中國管理科學(xué)研究院武書連、呂嘉、郭石林的《2006中國大學(xué)研究生院評價》。清華大學(xué)研究生院、北京大學(xué)研究生院、浙江大學(xué)研究生院連續(xù)5年蟬聯(lián)前3名。進(jìn)入前10名的大學(xué)還有：上海交通大學(xué)第4名、復(fù)旦大學(xué)第5名、南京大學(xué)第6名、華中科技大學(xué)第7名、中山大學(xué)第8名、武漢大學(xué)第9名、中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)第10名。

與上一年度的前10名相比較，清華大學(xué)研究生院、北京大學(xué)研究生院、浙江大學(xué)研究生院繼續(xù)以明顯的優(yōu)勢領(lǐng)先全國其他大學(xué)，清華、北大、浙大保持前三名已經(jīng)連續(xù)五年。上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并后，新上海交通大學(xué)研究生院上升到第4名。復(fù)旦大學(xué)研究生院由第4名下降到第5名，南京大學(xué)研究生院由第5名下降到第6名，華中科技大學(xué)研究生院保持第7名不變，中山大學(xué)研究生院由第10名上升到第8名，武漢大學(xué)研究生院由第8名下跌到第9名，中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)研究生院進(jìn)入前10名，吉林大學(xué)研究生院跌出前10名。
　　武書連指出，本年度清華大學(xué)研究生院的得分不包括清華大學(xué)北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的得分。他說，幾年來，《中國大學(xué)評價》課題組一直關(guān)注清華大學(xué)與中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)的關(guān)系，但清華大學(xué)與中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)合作了幾年究竟是什么關(guān)系卻一直不得要領(lǐng)。中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)與中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院實行院校合一的管理體制，實際是一個單位兩塊牌子，前不久中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)更名為北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院，又名清華大學(xué)北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院，那么現(xiàn)在北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的教學(xué)科研得分應(yīng)該統(tǒng)計在清華大學(xué)名下還是統(tǒng)計在中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院名下？這需要在體制上理順。

武書連強(qiáng)調(diào)，與前幾年相比，《2006中國大學(xué)研究生院評價》的數(shù)據(jù)采集和指標(biāo)權(quán)重有以下幾個主要變化。
　　1、國內(nèi)的中文源期刊采用了《中國大學(xué)評價》課題組創(chuàng)建的專門用于大學(xué)和科研單位學(xué)科評價的《科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫》（Science Citation Database，英文縮寫：SCD）�！犊茖W(xué)引文數(shù)據(jù)庫》采用各一級學(xué)科教學(xué)科研人員的人數(shù)比例與該一級學(xué)科期刊載文量比例相同的方法確定各一級學(xué)科期刊的入選數(shù)量。SCD的創(chuàng)建，使不同學(xué)科的科研人員能夠在同等投稿命中率的基礎(chǔ)上公平競爭，建立了自然科學(xué)與社會科學(xué)論文的一一對應(yīng)關(guān)系，以及自然科學(xué)各一級學(xué)科、社會科學(xué)各一級學(xué)科論文的一一對應(yīng)關(guān)系，實現(xiàn)了不同學(xué)科優(yōu)秀論文數(shù)量的直接可比。
　　2、降低國外期刊論文得分�？紤]到目前我國學(xué)者在國外期刊發(fā)表的論文的實際質(zhì)量，將SCI源期刊論文由每篇3.8分降為3分，EI源期刊論文由每篇2.5分降為1.5分。國內(nèi)論文保持每篇1.5分不變。
　　3、提高論文被引用得分。與高速增長的的論文數(shù)量相比，我國學(xué)者的論文被引用次數(shù)較低。為了使論文質(zhì)量的評價更接近實際，將每篇論文每被引用一次由2.5分增加到3分（不含作者自引）。